新的事业开始了，邓起东在新的岗位上跟着张文佑和马宗晋等老专家、老同志努力工作和学习，在他们的指导下，在北京西山做小构造研究，在四川做油气构造研究，尤其是在1962.10.31-1963.12.26被派遣至中国地质科学院地质力学研究所地质力学第1期进修班学习，直接接受李四光院士等多位专家的指导和教育，参加多种科研活动，大大地增加了知识，开阔了眼界。在这一阶段他对剪切和张性破裂变形及其形成机制有创造性发展，发表了有关论文。